Home |Contacts |Order |Catalog |Support
 Search |Alphabetical Index |Numerical Index
Fermentas ISO9002
 Restriction Endonucleases |Modifying Enzymes |PCR |Kits |Markers  Nucleic Acids
|Nucleotides & Oligonucleotides |Media |Transfection Reagents |Reagents

S

U

P

P

O

R

T

 

Commercial Restriction Endonucleases Sorted by Generated DNA Ends

 Note 

Asymmetric sequences are indicated by *.

Single letter code:
R = G or A; 
Y = C or T; 
W = A or T; 
M = A or C; 
K = G or T; 
S = C or G;
H = A, C or T;
V = A, C or G;
B = C, G or T;
D = A, G or T;
N = G, A, T or C.

Enzymes Generating 5'-protruding Ends

A,C    G    Y,R,T,W

Recognition
sequence
Enzyme 5'-protruding end (5'=>3')
1nt 2nt 3nt 4nt 5nt
AA^CGTT Psp1406I    CG      
A^AGCTT HindIII        AGCT  
^AATT TasI        AATT  
A^CATGT BspLU11I       CATG  
A^CCGGT BshTI        CCGG  
ACCTGC(4/8)^*  BveI       NNNN  
A^CCWGGT SexAI          CCWGG
A^CGCGT MluI        CGCG  
A^CRYGT AflIII        CRYG  
A^CTAGT BcuI        CTAG  
A^GATCT BglII        GATC  
AT^CGAT Bsu15I    CG      
AT^TAAT VspI   TA      
C^AATTG MunI        AATT  
CACCTGC(4/8)^* AarI       NNNN  
CACGAG(-5/-1)^* BssSI        ACGA  
CA^TATG NdeI    TA      
^(13/9)CATCC* Fok       NNNN  
C^CATGG NcoI        CATG  
CCCGC(4/6)^* SmuI    NN      
C^CCGGG Cfr9I        CCGG  
CCGC(-3/-1)^* Aci   CG      
C^CGG HpaII    CG      
C^CGG MspI    CG      
^CCNGG BssKI          CCNGG
CC^NGG Bme1390I  N        
C^CNNGG BseDI        CNNG  
C^CRYGG Dsa       CRYG  
CC^SGG BcnI  S        
C^CTAGG XmaJI        CTAG  
CCTCAGC(-5/-2)^* BbvCI     TCA    
CCTNAGC(-5/-2)^* Bpu10I      TNA    
CC^TNAGG Eco81I      TNA    
CCTNN^NNNAGG XagI  N        
CC^WGG MvaI  W        
C^CWWGG Eco130I        CWWG  
C^GGCCG Eco52I        GGCC  
CG^GWCCG CpoI      GWC    
C^GTACG Pfl23II        GTAC  
CGTCTC(1/5)^* Esp3I        NNNN  
C^YCGRG Eco88I        YCGR  
CR^CCGGYG SgrAI        CCGG  
C^TAG Mae   TA      
C^TCGAG XhoI        TCGA  
CTCGTG(-5/-1)^* BssSI        TCGT  
CTCTTC(1/4)^* Eam1104I      NNN    
C^TYRAG SmiI        TYRA  
C^TNAG Dde     TNA    
C^TRYAG BfmI        TRYA  
C^TTAAG BspTI        TTAA  

 

 G

Recognition
sequence
Enzyme 5'-protruding end (5'=>3')
1nt 2nt 3nt 4nt 5nt
GAAGAC(2/6)^* BpiI        NNNN  
^(4/1)GAAGAG* Eam1104I      NNN    
^(4/1)GAAGAGC* Sap     NNN    
G^AATTC EcoRI        AATT  
GACGC(5/10)^* Hga         NNNNN
GACN^NNGTC PsyI  N        
^(5/4)GACTC* Ple N        
^(5/1)GAGAC* Alw26I        NNNN  
^(5/1)GAGACC* Eco31I        NNNN  
^(5/1)GAGACG* Esp3I        NNNN  
GAGTC(4/5)^* Ple N        
G^ANTC HinfI      ANT    
^GATC Bsp143I        GATC  
^GATC MboI        GATC  
^(5/4)GATCC* BspPI  N        
^(9/5)GATGC* LweI        NNNN  
G^AWTC TfiI     AWT    
GCAGC(8/12)^* BseXI        NNNN  
^(8/4)GCAGGT* BveI       NNNN  
GCATC(5/9)^* LweI        NNNN  
G^CGC Hin6I    CG      
G^CGCGC PauI        CGCG  
GCGG(-3/-1)^* Aci   CG      
GC^GGCCGC NotI        GGCC  
^(6/4)GCGGG*  Fau   NN      
^(10/5)GCGTC* Hga         NNNNN
GC^NGC SatI  N        
G^CTAGC NheI        CTAG  
GCTCTTC(1/4)^* Sap     NNN    
GCTGAGG(-5/-2)^* BbvCI      TGA    
^(12/8)GCTGC* BseXI        NNNN  
GC^TNAGC Bpu1102I      TNA    
GCTNAGG(-5/-2)^* Bpu10I      TNA    
G^CWGC Tse     CWG    
GGATC(4/5)^* BspPI  N        
G^GATCC BamHI        GATC  
GGATG(9/13)^* Fok       NNNN  
GG^CGCGCC Asc       CGCG  
GGGAC(10/14)^* BsmFI        NNNN  
G^GGCCC Bsp120I        GGCC  
GG^GWCCC SanDI      GWC    
G^GYRCC BshNI        GYRC  
G^GNCC Cfr13I      GNC    
G^GTACC Acc65I        GTAC  
GGTCTC(1/5)^* Eco31I        NNNN  
G^GTNACC Eco91I          GTNAC
G^GWCC Eco47I      GWC    
GR^CGYC Hin1I    CG      
G^TAC Csp6I    TA      
^(14/10)GTCCC* BsmFI        NNNN  
G^TCGAC SalI        TCGA  
GTCTC(1/5)^* Alw26I        NNNN  
^(6/2)GTCTTC* BpiI        NNNN  
G^TGCAC Alw44I        TGCA  
GT^MKAC XmiI    MK      
^GTNAC MaeIII          GTNAC
^GTSAC NmuCI          GTSAC

  

 Y, R, T, W

Recognition
sequence
Enzyme 5'-protruding end (5'=>3')
1nt 2nt 3nt 4nt 5nt
Y^GGCCR CfrI        GGCC  
R^AATTY XapI        AATT  
R^CCGGY Cfr10I        CCGG  
R^GATCY PsuI        GATC  
RG^GNCCY EcoO109I      GNC    
RG^GWCCY Psp5II      GWC    
T^CATGA PagI        CATG  
T^CCGGA Kpn2I        CCGG  
T^CCNGGA PfoI         CCNGG
T^CGA TaqI    CG      
T^CTAGA XbaI        CTAG  
T^GATCA BclI        GATC  
T^GTACA Bsp1407I        GTAC  
T^TAA Tru1I    TA      
TT^CGAA Bsp119I    CG      
W^CCGGW BsaWI        CCGG  
W^GTACW TatI        GTAC  

 Home |Search |Contacts |Order |Catalog |Support

catalog@fermentas.com

Updated October 22, 2002 12:50